El 1ero de noviembre de 1673 los padres Juan Manuel Gamboa y Fernando Barrionuevo partieron desde Parral hacia el norte para dar comienzo a la nueva expansión, sin embargo el invierno quebranto la salud de Barrionuevo  que fue destinado a la misión de Satevó y fue sustituido para esta tarea por el padre José Tardá que anduvo junto con Gamboa por algún tiempo, fundando por ejemplo la misión de San Bernabé que abarcaba las comunidades de Huichochi, Carichi y Cusihuiriachi, la cual no prospero mucho y se vino a ver diezmada por el descubrimiento de los yacimientos de oro en Cusihuiriachi que atrajeron a centenas de españoles. El padre Gamboa también cayó enfermo y fue reemplazado por Tomás Guadalajara,  que en conjunto con el P. Tardá formaron un equipo fuerte y dinámico para el desarrollo de las actividades apostólicas en los nuevos territorios, convirtiéndose a quienes debemos gran parte de la evangelización  de la región norte y oeste de la tarahumara, conocida como la Alta Tarahumara.

Hubo un tarahumara llamado Don Pablo, digno de mencionar en esta historia, ya que se anticipaba a los misioneros y lograba que pueblos tarahumaras lejanos estuvieran dispuestos a recibirlos. Tardá y Guadalajara (principalmente este último) crearon misiones en el Papigochi, Carichi, Tutuaca, Nonoava, Temechi, Matachi, que abarcaban otros varios pueblos. Esta expansión trajo la necesidad de que mas jesuitas apoyaran la creciente misión tarahumara, por lo que fueron enviados algunos nuevos.

En 1678 llega a la misión el mas celebre Padre de la Tarahumara, el alemán José Neumann, junto con el P.Ratkay que haría el primer mapa de las misiones tarahumaras, lamentablemente falleció 2 años después, Neumann que llego a Sisogichi,  tuvo 54 prósperos años de trabajo en la tarahumara. En 1697 estallo una nueva rebelión trayendo mucha destrucción a las misiones de la Alta Tarahumara,  la cual fue combatida por el  capitán José Fernández de Retana.

En los primeros años del siglo XVIII, España entro en la guerra de sucesión, viendo afectada su economía, por lo que pidió a todas sus colonias en el nuevo mundo que evitaran al máximo provocar a los indios a rebeliones,  por lo que se cambiaron varias estrategias, empezando porque ya no se perseguiría a los indios que desertaran de vivir en los pueblos de misión y quisieran regresar a vivir en las cuevas, además dejar el castigo de los desobedientes en manos de los gobernadores indios y no de los españoles, todo esto trajo mejor fortuna para las misiones y los misioneros, a los que los indios que huían a las cuevas seguían invitando a bautizarlos e incluso les construían templos y casas.

Para 1718 se fundó el Colegio Jesuita de Nuestra Señora de Loreto en la nueva ciudad de San Felipe el Real, actual Cd. Chihuahua. Aproximadamente durante la segunda década del siglo XVIII llegó a la misión de Carichí donde residía el ya veterano P. Neumann, otro famoso jesuita el P. Francisco Glandorff promotor de la misión de Tomochi, fueron muchos los milagros que se le atribuyeron, además de ganar fama de recorrer grandes distancias en tiempos inverosímiles.

En 1753, fueron secularizadas las misiones de la baja tarahumara.  En 1767 por diversas razones, intrigas, cuestiones políticas y sociales sucedías en Europa, el Rey Carlos III decidió que los Jesuitas serian expulsados de la Nueva España y  el resto de las colonias españolas en el nuevo mundo.  En cuestión de días los Padres fueron sacados de sus queridas misiones y colegios y enviados de regreso a España, muchos murieron antes de poder embarcar.

En general, los Jesuitas fundaron en el estado de Chihuahua casi 200 pueblos, de los cuales podemos aun hoy, encontrar aproximadamente 160 templos originados por su actividad misional.